寺中最有特色的文物和佛教藝術(shù)品，一是象征著香火日盛的鎮(zhèn)寺之寶——祖印寶鼎，高達(dá)3.4米，重1.5噸；二是1995年從緬甸迎請來的玉觀音坐像，高2.2米，重2噸多，玉質(zhì)精細(xì)優(yōu)良，雕刻工藝精美，形態(tài)端莊大方，現(xiàn)供奉于后大殿；三是大雄寶殿的建筑藝術(shù)和塑像。大雄寶殿有7間，高17.5米，通進(jìn)深19米，通面闊29.6米，總面積達(dá)564平方米。重檐歇山頂，上檐九踩斗拱，十三架梁，明間抬梁，左右次、梢、盡穿斗結(jié)構(gòu)，建筑藝術(shù)高超精致。殿內(nèi)主供三世佛像。正中供奉釋迦牟尼佛，左右有迦葉尊者、阿難尊者護(hù)持。東西兩側(cè)沿壁塑有十八羅漢像和五百羅漢像。

　　寺中殿宇雕龍畫鳳，玲瓏精美，是佛教建筑中的藝術(shù)精品。寺中古建筑物保存較完好，對于研究清代寺廟建筑風(fēng)格有著重要意義。自宋至民國的數(shù)百年中，祖印寺都是定海縣的佛教中心，對佛教在舟山本島的傳播及發(fā)展有著巨大影響。祖印寺的歷史作為佛教在中國發(fā)展的縮影，也反映了佛教在海島發(fā)展的個性特點(diǎn)。