明清期間，在該寺正殿四周又陸續(xù)興建了許多偏殿樓閣：東廡有送子觀音殿、伽藍殿；西廡有十王殿、痘司殿；寺東有東岳行宮、忠顯王殿；寺西有城隍行宮、地藏殿；寺前有韋馱殿、鄂王殿、魯班殿、財神殿、北方殿；寺后有大悲閣、文昌閣、西方境等，形成規(guī)模頗大的寺廟建筑群。該寺正殿曾歷經修葺，明洪武年間及弘治年間，僧道馨、法雷2次重修。清光緒二十年（1894年）又由真如鎮(zhèn)米商楊氏發(fā)起，同上海壽圣庵僧念岸、念倫募錢1.5萬緡（千文），將單檐3間改成雙檐5間，原梁架等主體結構仍保留元代款式，兩側楹聯(lián)：東為“佛日光輝崇盛世群生咸悟真如”，西為“皇風祥輯衍遐齡萬姓同躋仁壽”。該寺韋馱殿，據洪復章《真如里志》載：“元至順三年，平江路嘉定州僧嗣文創(chuàng)建，明正德八年僧法雷重建。清乾隆三年里人陸偉功重修，乾隆四十年陸偉功、陸茂功捐資同修�！钡顑戎�名的銅彌勒佛系明代所制，銅佛背后鐫有“明乙酉年住山比丘回聞募鑄。”太平天國及抗日戰(zhàn)爭時期，幾經戰(zhàn)火，配殿及附屬建筑大多被毀，僅存長、寬各20米的正殿（大雄寶殿）1座。