三寶樹是因三株特殊的古樹而得名的，兩棵柳杉，一棵銀杏。因這三樹在黃龍寺山門前,有“廟堂之寶”的稱譽,故名“三寶樹”。據(jù)樹下巨巖上所刻“婆羅寶樹， 僧曇詵手桿十字來看，已有一千六百多年。曇詵為大林寺創(chuàng)始人，東林寺高僧慧遠的弟子。柳杉原名“婆羅”，是從西域引來的樹種，銀杏名為“白果”，為第四紀冰川的遺留植物，有“活化石”之稱，因為祖輩植樹，孫輩才能結(jié)果，故名“公孫果”。三樹凌空，高約四十米，粗約四人合抱這里原本杉數(shù)千株，古木參天，后因康熙五十年（1717年）僧人盜伐，僅剩下這三棵古樹，據(jù)專家考證，實為明代所植，明萬歷四十年（1618年）旅行家徐霞客在《廬山游記》中記載：“黃龍寺畔，樹大三人合圍，非檜非杉，枝頭著子累累”。據(jù)此推算，三寶樹至少已有四百年的歷史，據(jù)傳三棵古樹在明代神宗皇帝手上曾險些被害。相傳神宗皇帝在黃龍寺設(shè)臨時行宮，想用三樹樁天然賀桌舉行宴會，命百匠砍鋸。百名匠怎么砍也沒用，鋸拉不進，皇帝發(fā)怒下旨要殺工匠，眾工匠只得轉(zhuǎn)樹哭泣。三寶樹感動開口教長匠如何砍鋸自己，從匠為之感動，認為樹有情，人豈可無義。眾匠抱著寧死不伐三樹之心，皇帝獲悉，贊賞樹有情人有義勇，收回圣命“三寶樹”從此保存至今。